Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF4Q15306 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms