Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF6Q15052 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms