Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHPRHQ149N8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHPRHQ149N8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
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