Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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