Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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