Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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