Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms