Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HTR4Q13639 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms