Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
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