Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms