Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2BQ13554 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2BQ13554 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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