Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms