Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms