Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
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