Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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