Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RESTQ13127 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RESTQ13127 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RESTQ13127 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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