Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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