Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFRD2Q12894 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms