Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms