Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms