Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms