Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms