Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms