Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4BQ07343 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms