Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms