Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX1Q04741 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX1Q04741 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX1Q04741 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMX1Q04741 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms