Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms