Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB1Q02818 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms