Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms