Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTCQ00610 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTCQ00610 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTCQ00610 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms