Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms