Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC1P78348 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms