Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2BP67870 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms