Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK11-1P61568 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms