Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAP25P60880 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms