Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB15P59190 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB15P59190 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB15P59190 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms