Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA9P57773 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA9P57773 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms