Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCBP4P57723 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms