Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AFDNP55196 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AFDNP55196 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AFDNP55196 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms