Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRCA2P51587 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRCA2P51587 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms