Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSEN1P49768 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSEN1P49768 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms