Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPFP49454 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPFP49454 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPFP49454 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPFP49454 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CENPFP49454 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CENPFP49454 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPFP49454 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CENPFP49454 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPFP49454 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPFP49454 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CENPFP49454 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPFP49454 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPFP49454 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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