Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTBP49356 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms