Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms