Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms