Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHKA1P46020 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms