Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA4P43681 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms