Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LTBRP36941 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBRP36941 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBRP36941 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBRP36941 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBRP36941 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBRP36941 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBRP36941 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBRP36941 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBRP36941 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBRP36941 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBRP36941 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBRP36941 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms