Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms