Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF1P30408 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms